我國即將於10月13日大幅開放邊境管制，但BA.5本土疫情仍居高不下。中央流行疫情指揮中心宣布今（9）日新增4萬4457例本土個案，連續14天較前一周同期上升，指揮中心發言人莊人祥表示，與上周日相比，增加1216例，上升2.8%，仍處於在高原期，何時趨勢下降，仍是未知數。

中央流行疫情指揮中心在5日宣布將莫德納次世代疫苗的接種資格開放18到49歲，只要符合資格（前次疫苗間隔時間等）即可接種。對此台北市衛生局宣布，從今（6）日起即可預約接種莫德納次世代疫苗。

肺炎本土疫情仍屬高原期，面臨秋冬季的流感病毒旺盛期，不少專家提醒應小心肺炎與流感夾擊。中央流行疫情指揮中心醫療應變組副組長羅一鈞表示，流感與肺炎的症狀相當接近，兩者都有鼻塞、發燒、咳嗽、頭痛與肌肉痠痛等症狀。

昨（19）日公布國內有4例BA.4.6個案，醫療應變組副組長羅一鈞表示，這4例BA.4.6個案都是輕症，國際報告也沒看到針對BA.4.6提到較為嚴重的研究。國際間關注的除了BA.5以外，BA.4.6與BA.2.75全數屬於輕症化。是否造成雙主流，BA.4.6雖傳播力比BA.5高，但BA.4.6在英美的佔比偏低，能不能超過BA.5還要再觀察。過去BA.2.75曾傳出會蓋過BA.5，但全球主流株還是BA.2近期還有2到3個月的時間會居於主流。未來可能演化出更強的變異株，必須觀察是否有更多變異株出現。

今（18）天新增3萬9394例本土個案、157本土中重症案例、39人死亡，指揮中心發言人莊人祥表示，與上周日確診人數相較，增加4776例，增幅達23.5%。

這波本土疫情爆發以來，已累積31例幼童重症腦炎個案，造成11名小朋友死亡，比率高於許多國家，三軍總醫院找到致病關鍵，那就是變異株亞型BA.2.3.7的突變位點K97E，研究證實，該變位點將干擾病童免疫系統，誘發「免疫風暴」， 惡化成急性腦炎或全身系統性的發炎疾病。

在各國大開國門時，我國邊境解封指日可待。中央流行疫情指揮中心指揮官王必勝今（14）日證實，已經通過「旅行業辦理出（入）境團體旅客操作指引」，為了未來的旅遊做準備。然因為本土疫情正值高峰，須待趨勢向下後再作規劃。

中央流行疫情指揮中心今（12）日公布國內新增234例Omicron亞型變異株確定病例，本土病例為88例BA.5、86例BA.2，境外移入為5例BA.4、50例BA.5、1例BA.2.75、4例BA.2。其中以北部有45例為最多，中部34例、南部8例、東部1例。其中兒童與青少年，共有15人。