中央流行疫情指揮中心今（28）日在記者會上宣布，111年公費流感疫苗自11月1日起開始第2接段施打，公費對象為50歲到64歲沒有高風險慢性病成人。王必勝公布，公費流感疫苗自11月起開始第2接段施打，對象為50歲到64歲沒有高風險慢性病成人，而第1階段開放的對象如果未接種，第2階段的時間依然可以前往打疫苗。

有關接種高端疫苗者在赴日前須自費做PCR之爭議，部分輿論認為高端公司應對此提出協助方案。在24日，高端公司發布新聞稿，宣布從28日起將提供免費PCR。高端表示，依日本現行防疫規定，入境者須打滿3劑列入WHO緊急使用清單（EUL）之疫苗或檢附PCR陰性證明。除中央疫情指揮中心宣佈補打疫苗措施外，該公司考量社會責任、企業形象及股東權益，並參考律師提供之法律意見書與各界意見反饋，評估可在財務負擔允許及合理範圍內，協助政府一起解決部分國人赴日的不便，將於年底前免費提供接種高端新冠疫苗之民眾赴日前PCR檢測服務。

中央流行疫情指揮中心表示，今（24）日新增19例疫苗接種不良事件，9例嚴重個案中，有4例死亡。死亡個案的其中1人為93歲女性，於7月29日接種第1劑，返家後在7月31日陸續出現心臟不適，呼吸喘，送到急診室前休克死亡，打疫苗至死亡僅2天。

莫德納次世代疫苗從9月24日開打至今，中央流行疫情指揮中心今日說明目前共累計有100多萬人接種，台中的接種率最高，占可接種人數10.7%。另外，有關選舉日的居隔者投票議題，指揮中心指揮官王必勝表示將在投票前調整防疫措施，讓所有人都能投票。另外社區的防疫措施，例如體溫計是否撤除，王必勝表示正在徵詢專家意見。

因高端疫苗尚未通過WHO的團結試驗，使得接種高端疫苗的民眾入境日本卡關，中央流行疫情指揮中心更緊急推出補打措施，不少人認為這代表高端疫苗是無效的。中央流行疫情指揮中心在今（21）日邀請傳染病防治諮詢會預防接種組召集人，台大醫院醫師李秉穎說明此事。李秉穎表示，日本政府不採證高端疫苗，表示高端疫苗無效，這個說法是「邏輯不通」的，因為免疫橋接並非僅台灣這麼做，而是WHO認可的國際趨勢。

近日指揮中心開放「補打」措施，讓接種高端疫苗而需要做PCR才能入境日本者，能夠多接種疫苗；此舉更被質疑花人民納稅錢為高端善後。今（20）日中央流行疫情指揮中心指揮官王必勝表示，首先無條件入境免隔離之國家有：韓國、澳洲、紐西蘭、泰國、法國、義大利、英國、德國、阿根廷、南非。

近期與高端疫苗相關之批評頻繁出現，在中央流行疫情指揮中心記者會上，指揮官王必勝再次出現駁斥此事。王必勝嚴正強調，討論政策與防疫理論都可以，指涉貪汙、違法都很嚴重，必須有證據。指揮中心受立法院、監察院監督，也有審計部調查帳目。如果有人質疑有貪瀆，不法，想向檢調檢舉，指揮中心將會尊重並配合調查，「禁得起考驗」。

選舉逼近，前台北市副市長黃珊珊與指揮中心相關評論相當多。今（19）日黃珊珊受訪時說，如接種高端疫苗而須自費做PCR，高端公司應提出全額或部分補貼給這些須PCR的民眾。對此中央流行疫情指揮中心指揮官王必勝表示端看高端決定，且指揮中心有與高端聯繫。同時針對指揮中心以及前指揮官，同為台北市長參選人陳時中的質疑，王必勝也有說法。