食藥署在10月26日召開專家會議，討論BNT（BioNTech） BA.1及BA.4／5雙價疫苗與莫德納（Moderna） BA.4／5雙價疫苗之專案輸入申請案。最後決議， Moderna BA.4／5雙價疫苗之專案輸入，適用於12歲以上青少年及成人之主動免疫接種。

新冠疫情及季節性流感來勢洶洶，新冠確定病例每日仍新增3萬餘例，加上今年類流感門急診就診病例百分比有上升趨勢，呼籲民眾應儘速完成疫苗接種，50歲以上民眾自11月1日起開放接種公費流感疫苗，新北市接種流感疫苗提供「合約院所」、「社區設站」、「新北市疫苗預約系統預約接種」多元管道便利民眾接種，且自今日（10月26日）起開放第10期疫苗接種預約，民眾可多多利用，提升保護力。

近期廣受討論的是BA.5雙價疫苗有望抵台。中央流行疫情指揮中心在今（25）日透露BA.5雙價次世代疫苗。指揮官王必勝曾透露，莫德納與BNT的BA.5雙價疫苗資料已繳交完畢。指揮中心發言人莊人祥今（25）日表示，BA.5雙價疫苗最快在明（26）日進行EUA審查，審查後必須安排ACIP討論接種建議。接下來需要大約2週進行安排抵台時間等。至於進貨的大概時間，莊人祥僅稱「盡量安排」。

因高端疫苗尚未通過WHO的團結試驗，使得接種高端疫苗的民眾入境日本卡關，中央流行疫情指揮中心更緊急推出補打措施，不少人認為這代表高端疫苗是無效的。中央流行疫情指揮中心在今（21）日邀請傳染病防治諮詢會預防接種組召集人，台大醫院醫師李秉穎說明此事。李秉穎表示，日本政府不採證高端疫苗，表示高端疫苗無效，這個說法是「邏輯不通」的，因為免疫橋接並非僅台灣這麼做，而是WHO認可的國際趨勢。

中央流行疫情指揮中心在5日宣布從11日起擴大納入18到49歲民眾接種莫德納次世代疫苗追加劑，扣除近日確診者，約有780萬人可預約接種。不過，台北市衛生局在今（6）日上午開放18歲以上民眾預約莫德納次世代疫苗，有媒體詢問，多數北市診所已預約額滿，而目前次世代疫苗有271萬劑，符合接種資格者有780萬人，是否足夠一事引發討論。

中央流行疫情指揮中心今（29）日表示，今（2022）年採購之第4批莫德納（Moderna）次世代雙價疫苗60.5萬劑，已於今日上午抵達桃園國際機場，完成通關程序後，直接運送至指定冷儲物流中心進行後續檢驗封緘作業，再提供衛生福利部傳染病防治諮詢會預防接種組ACIP專家會議建議之優先對象接種追加劑使用。本批效期至2023年3月30日。

中央流行疫情指揮中心在（25）今日新增3萬8785例本土個案、223例中重症個案、34例死亡。指揮中心發言人莊人祥表示，從上周2起，單日新增病例數都比前1周同期稍微下降，且上周整體病例數較前1周減少3%，高原期應落在9月1日至17日，高原期通常持續1至2周，接下來將觀察何時脫離高原期。 莊人祥表示，今天新增34例死亡個案為14例男性、20例女性，年齡介於30 多歲至90多歲以上，其中32例具慢性病史、27例未接種3劑以上疫苗。確診日介於8月21日至9月22日，死亡日期介於9月12日至9月22日。

中央流行疫情指揮中心今（22）日表示，透過COVAX機制獲配的第2批Novavax疫苗50.4萬劑，已於今日上午抵達桃園國際機場，完成通關程序後，直接運送至指定冷儲物流中心進行後續檢驗封緘作業，再提供12歲以上民眾接種基礎劑、基礎加強劑及追加劑使用。本批預計在9月30日開始配送，效期至2022年12月31日。