受到部分媒體及電視名嘴們的批評，最近一、兩週來，國內新流感疫苗第二劑施打率明顯下滑，為了提高接種率，中央流行疫情指揮中心昨天指出，1從月9日起民眾可於各合約醫療院所選擇疫苗廠牌。
衛生署疾病管制局長郭旭崧指出，由於目前國光、諾華二廠牌H1N1新流感疫苗數量充足，昨天上午疾管局於1月6日上午與全國各地方衛生單位經過充分討論，將1月9日起方開放選擇廠牌。
另外，國小三年級 (含)以下需接種2劑的兒童與嬰幼兒，考量接種2劑不同廠牌疫苗之有效性與安全性尚無明確科學數據，故以接種相同廠牌為原則。5郭旭崧指出，針對9歲以下、需打第2劑的小朋友，雖然目前沒有證據顯示交替使用會有危險，指揮中心仍建議家長讓小朋友打同一廠牌的疫苗。
不過，小一至小三學童都在學校接種，校方醫護人員需準備兩種疫苗，在執行上有困難。因此，疾管局這次並未開放讓學生或家長在校內選擇疫苗。指揮中心強調，如果家長想自己選，還是可以帶孩子到校外醫療院所接種。
郭旭崧指出，依據最新H1N1新型流感疫苗到貨情況，目前全國國光疫苗以及諾華疫苗結存量分別為19萬劑以及169萬劑，庫存量充足且2廠牌數量相當。截至昨天為止，6個月到3歲的小朋友，第一劑施打率有4成1，第2劑卻只有1成5。學齡前兒童的接種率更低，從第1劑的3成2降到第2劑的1成。國內已施打完542萬劑疫苗，其中有471名需要施打2劑的小朋友，誤打不同廠牌的疫苗，不過都沒事。
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