公費HPV疫苗由原本僅國中女生，擴大到「113學年度入學」的全體國中生（男女皆可），由地方衛生局安排入校施打；未能配合校園場次者，也能夠持補接種通知單於期限內到合約院所完成施打。依各縣市公告顯示，114年9月起陸續入校開打第1劑。

國內爆發百日咳群聚感染，指標個案為1個月大的男嬰，8月中旬出現咳嗽症狀，因食慾下降、尿量減少、呼吸急促，而緊急就醫，住進加護病房，下旬確診百日咳。疫調發現，男嬰的媽媽、姊姊均有咳嗽症狀，9月初檢驗結果陽性，同樣確診，屬家庭群聚事件。

青少年也未能倖免，甚至貓、狗等毛小孩都可能因2手菸罹患呼吸道疾病及癌症。國民健康署呼籲民眾打造無菸家庭，並善用免費戒菸服務，避免心愛的家人與毛小孩暴露於2手、3手菸害之中。

人類乳突病毒（HPV）感染與多種癌症相關，除子宮頸癌，也可能導致口咽癌、肛門癌、外生殖器癌等，影響不限於女性。為此，衛生福利部宣布自今（114）年9月起，擴大HPV疫苗公費接種對象，由原先的國中女生擴大至國中男生，並呼籲家長與學生把握時機，完成疫苗接種，以強化防癌保護力。

國內《再生醫療法》與《再生醫療製劑條例》雙法，預計將於2026年1月1日正式上路，台灣正站上亞洲再生醫療制度創建的關鍵轉捩點，台灣精準醫學學會（TPMS）特別於2025年8月2至3日假台大醫院國際會議中心舉辦為期2天的「再生醫療臨床試驗教育訓練課程」。此次課程同步引入FACT（Foundation for the Accreditation of Cellular Therapy）制度規範，現場齊聚超過百位來自臨床、產業與政策領域的關鍵人士，實為制度與實務全面接軌的重要里程碑。

疾病管制署公布今年首例日本腦炎確定病例，個案為嘉義縣從事畜牧業50多歲男性，6月6日全身不適，6月7日因發燒就醫，隔天持續發燒，且煩躁不安，二度就醫。6月9日因發燒未緩解，且意識改變， 被收治住院治療，醫院通報及採檢確診日本腦炎，目前仍住院治療中。

隨著人口老化，公費流感疫苗採購數量逐漸增加，疾管署宣布，今年公費流感疫苗共採購647萬9080劑，較去年增加4.2萬劑。此外，公費流感疫苗從4價疫苗改為3價疫苗，共有5家藥廠供貨，其中國光生技316.5萬劑，占47.5%，不受前幾天實驗鼠亂事件的影響。

疾管署今（15）日公布國內新增1起麻疹群聚事件及2例境外移入麻疹個案。該起群聚感染事件為2名未滿1歲男嬰，皆曾於3月24日與境外移入個案有相同活動史，分別於4月3日及4月4日出現發燒、流鼻涕等症狀，經就醫採檢於4月11日確診，此為國內今（2025）年第2起境外移入個案致本土群聚事件。本起群聚事件累計確診3例，衛生單位已掌握2名男嬰相關接觸者共524名，預計監測至4月25日。另新增2例境外移入個案分別為中部1歲多男童及北部30多歲女性。2名個案均有越南旅遊史（分別至金甌省和富國島）返國後發病，經就醫通報檢驗確診。